Es una técnica de identificación masiva de proteínas usando la combinación de la cromatografía de líquidos de alto rendimiento (HPLC) acoplada a la espectrometría de masas (MS).
El número de proteínas identificadas depende de diversos factores:
- Complejidad de la muestra: a más compleja sea más «competencia» existirá entre péptidos dentro de la cromatografía y dentro del espectrómetro de masas. Para una mayor eficacia se puede prefraccionar/purificar la muestra.
- Tratamiento de la muestra: No existe un protocolo único para la extracción y digestión proteica, se ha de poner a punto el tratamiento adecuado al tipo de muestra y al tipo de proteínas de interés.
- Límite de detección del espectrómetro de masas: cada equipo tiene su limitación en cuanto a la velocidad de escaneo y precisión de masas, así como en capacidad de detección. Actualmente la equipación existente en el mercado ha llevado a mínimos la pérdida en detección obteniendo una cantidad inmensa de identificaciones de alta precisión.
SERVICIOS DE APOYO A LA INVESTIGACIÓN 