SEGMENTACIÓN DE NÚCLEOS MEDIANTE INTELIGENCIA ARTIFICIAL EN LA PLATAFORMA DE HIGH CONTENT ANALYSIS SCANR

El high content analysis (HCA) es una técnica instrumental que emplea microscopía automatizada en combinación con análisis de imagen en un formato de alto rendimiento. En nuestro centro, esta técnica se emplea principalmente para el estudio cuantitativo de eventos celulares complejos. Como tal, uno de los primeros pasos en el análisis es identificar correctamente cadaSigue leyendo «SEGMENTACIÓN DE NÚCLEOS MEDIANTE INTELIGENCIA ARTIFICIAL EN LA PLATAFORMA DE HIGH CONTENT ANALYSIS SCANR»

MEJORA DE IMÁGENES RUIDOSAS MEDIANTE INTELIGENCIA ARTIFICIAL

En un nuevo capítulo de cómo la inteligencia artificial puede ayudaros a sacar el máximo partido de vuestras imágenes científicas, hoy os presentamos distintos métodos para eliminar o reducir el ruido que se puede introducir durante la captura de estas imágenes. El ruido suele aparecer cuando, por el motivo que sea (normalmente relacionado con lasSigue leyendo «MEJORA DE IMÁGENES RUIDOSAS MEDIANTE INTELIGENCIA ARTIFICIAL»

II TÉCNICAS DE SUPERRESOLUCIÓN

2.1. STED o Stimulated Emission Depletion Microscopy. Stefan Hell desarrolló esta técnica utilizando dos rayos láser para iluminar la muestra: uno en configuración confocal que ilumina una región limitada por difracción, y otro que desactiva las moléculas en la orilla de esta zona por emisión estimulada. El segundo láser logra lo anterior gracias a queSigue leyendo «II TÉCNICAS DE SUPERRESOLUCIÓN»

INTRODUCCIÓN A LA SÚPER-RESOLUCIÓN

La microscopía óptica es una de las herramientas más importantes de las ciencias en general y en la biología en particular ya que permite observar en un tamaño aumentado elementos que son imperceptibles a simple vista. A través de los años se han desarrollado numerosas técnicas para mejorar tanto el contraste como la calidad deSigue leyendo «INTRODUCCIÓN A LA SÚPER-RESOLUCIÓN»

STARDIST: DETECCIÓN DE OBJETOS EN IMÁGENES MEDIANTE DEEP LEARNING

En el artículo del 20 de abril os hablamos de un plugin de FIJI (Trainable WEKA segmentation)que utiliza el machine learning para ayudarnos a segmentar las imágenes clasificando los píxeles en distintas categorías de interés. Hoy os queremos hablar de otra herramienta (StarDist) que utiliza redes neuronales convolucionales, dentro del campo del deep learning (unSigue leyendo «STARDIST: DETECCIÓN DE OBJETOS EN IMÁGENES MEDIANTE DEEP LEARNING»

LIGHT-SHEET MICROSCOPY O MICROSCOPIA DE LAMINA DE LUZ

La manera de obtener imágenes tridimensionales de la médula a buena resolución y en poco tiempo. En la newsletter de hoy el SMAI quiere presentaros la microscopía de fluorescencia de lámina de luz o LSFM acrónimo de la técnica en inglés (Light sheet fluorescent microscopy). Esta es una técnica de microscopía de fluorescencia con unaSigue leyendo «LIGHT-SHEET MICROSCOPY O MICROSCOPIA DE LAMINA DE LUZ»

Trainable Weka segmentation. Un plugin de machine learning para FIJI

En este primer artículo del SMAI dentro de la Newsletter de los SAIs queremos hablaros de una posibilidad probablemente desconocida para la muchos de vosotros, que es el uso con FIJI de machine learning para el análisis de vuestras imágenes. Como sabéis, una de las partes fundamentales  en el análisis de imagen es distinguir losSigue leyendo «Trainable Weka segmentation. Un plugin de machine learning para FIJI»