¿Has observado alguna alteración en tus células tras separarlas? ¿Cómo podemos conseguir sacar lo mejor de nuestras células separadas? ¿Qué es el SICS? Sus siglas hacen referencia a Sorter Induced Cellular Stress y, por tanto, es el estrés que sufren las células separadas, a partir de una muestra homogénea, mediante un citómetro separador o cell sorting. La mayoríaSigue leyendo «SICS: problemas en la viabilidad y funcionalidad celular tras la separación»
Archivo del autor: SAIs - HNP
Trainable Weka segmentation. Un plugin de machine learning para FIJI
En este primer artículo del SMAI dentro de la Newsletter de los SAIs queremos hablaros de una posibilidad probablemente desconocida para la muchos de vosotros, que es el uso con FIJI de machine learning para el análisis de vuestras imágenes. Como sabéis, una de las partes fundamentales en el análisis de imagen es distinguir losSigue leyendo «Trainable Weka segmentation. Un plugin de machine learning para FIJI»
Comparing SRM and SWATH Methods for Quantitation of Bovine Muscle Proteomes
ABSTRACT Mass spectrometry (MS) has become essential for efficient and accurate quantification of proteins and proteomes and, thus, a key technology throughout all biosciences. However, validated MS methods are still scarce for meat quality research applications. The objective of this work was to develop and compare two targeted proteomic methods, namely, selected reaction monitoring (SRM)Sigue leyendo «Comparing SRM and SWATH Methods for Quantitation of Bovine Muscle Proteomes»
A Co-registration Pipeline for Multimodal MALDI and Confocal Imaging Analysis of Stem Cell Colonies
ABSTRACT Multimodal mass spectrometry imaging (MSI) data presents unique big data challenges in handling and analysis. Here, we present a pipeline for co-registering matrix-assisted laser desorption/ionization MSI and confocal immunofluorescence imaging data for extracting single-cell metabolite signatures. We further describe methods and introduce software for the simultaneous analysis of these concatenated data sets, which areSigue leyendo «A Co-registration Pipeline for Multimodal MALDI and Confocal Imaging Analysis of Stem Cell Colonies»
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