En el artículo del 20 de abril os hablamos de un plugin de FIJI (Trainable WEKA segmentation)que utiliza el machine learning para ayudarnos a segmentar las imágenes clasificando los píxeles en distintas categorías de interés. Hoy os queremos hablar de otra herramienta (StarDist) que utiliza redes neuronales convolucionales, dentro del campo del deep learning (unSigue leyendo «STARDIST: DETECCIÓN DE OBJETOS EN IMÁGENES MEDIANTE DEEP LEARNING»
Archivo del autor: SAIs - HNP
Imagen de Resonancia magnética funcional fMRI
En este segundo capítulo del Servicio de Resonancia Magnética de Investigación queremos hablaros en una pequeña introducción de la imagen funcional por Resonancia Magnética, la cual permite estudiar la funcionalidad, conectividad y actividad cerebral. A dia de hoy, hay una gran variedad de estudios de fMRI en los que se varía el tipo de anestesia,Sigue leyendo «Imagen de Resonancia magnética funcional fMRI»
SUFRIMIENTO Y DOLOR EN ANIMALES DE EXPERIMENTACIÓN
¿Qué es el estrés en un animal de laboratorio? ¿Y el sufrimiento? ¿Y el dolor? Antes de saber las respuestas a estas preguntas tenemos que saber cuándo un animal se encuentra en óptimas condiciones físicas y mentales. En este caso, se encuentra en un estado de bienestar cuando hay una armonía entre el animal ySigue leyendo «SUFRIMIENTO Y DOLOR EN ANIMALES DE EXPERIMENTACIÓN»
VESÍCULAS EXTRACELULARES
Las vesículas extracelulares (EVs) son pequeñas partículas rodeadas por una bicapa lipídica que son secretadas por todo tipo de células, y que constituyen un mecanismo de comunicación intercelular muy importante. Todas las células que se encuentran creciendo activamente o en una situación de estrés, van a secretar EVs al medio externo. A lo largo deSigue leyendo «VESÍCULAS EXTRACELULARES»
CUIDADO CON LAS LÍNEAS CONSANGUÍNEAS
Cuando comenzamos a trabajar con roedores de laboratorio empezamos a aprender mucho sobre líneas de ratones que existen a disposición de los investigadores. Es un mundo lleno de posibilidades. Aprendemos que los ratones consanguíneos son una herramienta muy útil que nos permite disminuir el número de animales que utilizamos en nuestros experimentos debido a lasSigue leyendo «CUIDADO CON LAS LÍNEAS CONSANGUÍNEAS»
¿Existe el protocolo perfecto?
Algo en lo que insistimos en nuestros cursos de formación y que muchos alumnos nos preguntan es por la preparación de las muestras. Los más veteranos ya sabréis la respuesta. No, no existe un protocolo perfecto o universal que funcione bien para todo tipo de muestras. Las condiciones óptimas de preparación deben ser determinadas empíricamenteSigue leyendo «¿Existe el protocolo perfecto?»
Myelin Water Imaging
Empezamos la sección de la Newsletter del SAI RM tratando un tema de especial interés en vuestras líneas de investigación: ¿sería posible detectar la Mielina por Imagen de Resonancia Magnética? La respuesta es SI pero no con los técnicas de imagen convencionales, requiere de secuencias especiales y un análisis de imagen posterior. En este primerSigue leyendo «Myelin Water Imaging»
LIGHT-SHEET MICROSCOPY O MICROSCOPIA DE LAMINA DE LUZ
La manera de obtener imágenes tridimensionales de la médula a buena resolución y en poco tiempo. En la newsletter de hoy el SMAI quiere presentaros la microscopía de fluorescencia de lámina de luz o LSFM acrónimo de la técnica en inglés (Light sheet fluorescent microscopy). Esta es una técnica de microscopía de fluorescencia con unaSigue leyendo «LIGHT-SHEET MICROSCOPY O MICROSCOPIA DE LAMINA DE LUZ»
Clinical classifiers of COVID-19 infection from novel ultra-high-throughput proteomics
SUMMARY The COVID-19 pandemic is an unprecedented global challenge. Highly variable in its presentation, spread and clinical outcome, novel point-of-care diagnostic classifiers are urgently required. Here, we describe a set of COVID-19 clinical classifiers discovered using a newly designed low-cost high throughput mass spectrometry-based platform. Introducing a new sample preparation pipeline coupled with short-gradient high-flowSigue leyendo «Clinical classifiers of COVID-19 infection from novel ultra-high-throughput proteomics»
SWATH-MS®
SWATH-MS® (Sequential Window Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Mass Spectra) Es un método de adquisición que genera mapas de proteínas globales y cuantitativas utilizando la combinación de la adquisición de datos independientes (DIA) y el análisis de datos específicos, de esta forma, aumenta enormemente el rendimiento de identificación/cuantificación de péptidos en comparación con elSigue leyendo «SWATH-MS®»
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